Dispositifs expérimentaux

 

 

 

EBS supporte plusieurs dispositifs expérimentaux pour les essais de sélection qui peuvent être générés à l'aide de différents modèles, comme décrit dans le tableau ci-dessous.

Les paramètres de conception du modèle de dispositif sélectionné doivent être définis, et il est également possible de définir la forme de l'essai sur le terrain en plaçant le commutateur à bascule sur la position "Yes", puis en définissant les paramètres de disposition du champ.

Dispositifs et modèles expérimentaux

Dispositif

Nom du modèle

Description

Alpha-Lattice

Alpha-Lattice

Un type de dispositif en blocs incomplets résoluble, dans lequel tous les traitements ne sont pas testés dans le même bloc. Il s'agit d'un dispositif résoluble, car les blocs peuvent être disposés et regroupés pour former des répétitions complètes.

Paramètres de la conception : Nombre d’études (Essais), Nombre de répétitions, Nombre de blocs.

Paramètres de la disposition : Nombre de rangées par bloc, Nombre de rangées par répétition, Total du nombre de rangées du champ, Ordre du champ (Colonne serpentine, Ordre des colonnes, Rangée serpentine ou ordre des rangées).

Utilisation : Lorsque le nombre de traitements testés (entrées, génotypes) est très important, il est difficile d'avoir un champ uniforme pouvant supporter ce grand nombre de parcelles, nous construisons donc de petits blocs (blocs incomplets) au sein de la répétition. La taille du bloc ne doit pas être importante, même lorsque le nombre de traitements est élevé. Ce dispositif est plus souple que les dispositifs en treillis (qui exigent que le nombre de traitements soit un carré parfait et que la taille des blocs ou le nombre de parcelles dans chaque bloc soit égal à la racine carrée du nombre de traitements).

Alpha-Lattice | CIMMYT

Identique à l'Alpha-Lattice.

Différences :

L'utilisateur définit la taille du bloc au lieu du nombre de blocs.

Paramètres de disposition :

Nombre de parcelles jusqu'à ce que le diviseur de champ (enveloppe le serpentin).

Options du serpentin (vertical ou horizontal)

Dispositif IWIN

Ce modèle est généralement utilisé pour générer les essais de sélection qui sont également considérés comme des Pépinières internationales. Il génère un dispositif en Alpha-Lattice, mais il existe deux autres options pour restreindre le processus de randomisation.

C'est la même chose qu'Alpha-Lattice | CIMMYT, avec la différence suivante :

Ajoute des options de degré de randomisation (pour la première rép, les entrées peuvent être assignées aux parcelles par l'ordre dans lequel elles sont disposées dans la liste des entrées, et il y a une option pour utiliser la même randomisation pour toutes les études).

Dispositif expérimental en blocs aléatoires complets

RCBD

C'est le dispositif standard pour les expérimentations agricoles, la répétition est disposée en groupe, créant un facteur de contrôle local qui est appelé "Bloc". Chaque bloc contient une parcelle de chaque entrée. Il n'y a pas de limite théorique pour le nombre de blocs. Les entrées sont randomisées dans les blocs. Dans ce dispositif, le bloc et la répétition sont la même entité.

Paramètres de la conception : Nombre d’études (Essais) et Nombre de répétitions (Blocs)

Paramètres de la disposition : Rangées par répétition (Bloc), Nombre de rangées du champ et ordre du champ (Colonne serpentine, Ordre des colonnes, Rangée serpentine ou ordre des rangées).

Utilisation : Lorsque les unités expérimentales ne sont pas homogènes et qu'il est possible de regrouper les unités expérimentales en blocs de telle sorte que les unités expérimentales au sein de chaque bloc soient plus homogènes que celles entre les blocs. Il n'est pas recommandé lorsque le nombre d'entrées est trop important, car il est impossible d'avoir un champ avec une petite variation même à l'intérieur des blocs.

RCBD | CIMMYT

Identique à RCBD

Différences :

Paramètres de la disposition :

Nombre de parcelles jusqu'à ce que le diviseur de champ (enveloppe le serpentin)

Options du serpentin (vertical ou horizontal)

RCBD | OFT

Identique à RCBD

Différences :

Exclusivement pour les expérimentations en phase d'essai au champ

Chaque bloc est affecté à une étude (ou champ)

Pas d'option pour définir la forme du champ

Dispositif en rangée et colonnes

Rangée-Colonne

Un autre type de dispositif en bloc incomplet résoluble, comme l'Alpha-Lattice, mais avec une meilleure variation de champ, puisque ce dispositif permet de bloquer dans deux directions perpendiculaires l'une à l'autre.

Paramètres de la conception : Nombre d'études (essais), nombre de répétitions, nombre de blocs de rangées.

Paramètres de la disposition : Nombre total de rangées du champ, ordre du champ (colonnes en serpentin, ordre des colonnes, rangées en serpentin ou ordre des rangées)

Utilisation : Lorsque le nombre de traitements testés (entrées, génotypes) est très important, il est difficile d'avoir un champ uniforme pouvant supporter ce grand nombre de parcelles, nous construisons donc de petits blocs (blocs incomplets) au sein de la répétition. Ce dispositif est approprié s'il y a deux sources de variation et si la dimension du champ par répétition est aussi carrée que possible.

RCBD augmenté

RCB augmenté

Un autre type de dispositif en blocs incomplets dans lequel certains des traitements (entrées, génotypes) sont répétés tandis que les autres traitements ne sont pas répétés. Les traitements répétés sont appelés témoins et les traitements non répétés sont appelés tests. Les traitements répétés suivent la randomisation du RCBD (tous les traitements sont présents dans chaque bloc) tandis que les traitements non répétés sont distribués et intégrés dans chaque bloc.

Paramètres de la conception : Nombre d’études (Essais), Nombre de Blocs.

Paramètres de la disposition : Nombre total de rangées du champ, ordre du champ (colonnes en serpentin, ordre des colonnes, rangées en serpentin ou ordre des rangées)

Utilisation : Ce dispositif est souvent utilisé en début de génération, lorsque les semences ou les ressources sont limitées, lorsque l'utilisateur souhaite évaluer autant de génotypes que possible et lorsqu'il est difficile de maintenir des blocs homogènes lors de la comparaison de nombreux génotypes.

Dispositifs augmentés avec des témoins diagonaux

P-Rep CRD avec des témoins diagonaux systématiques

Un dispositif en blocs incomplets dans lequel certains traitements (entrées, génotypes) sont répétés tandis que les autres traitements ne sont pas répétés. Les traitements répétés sont appelés témoins et peuvent ensuite être classés comme spatiaux ou répétés. Les témoins répétés et les traitements non répétés sont complètement randomisés dans le champ, tandis que les témoins spatiaux sont positionnés en diagonale.

Paramètres de la conception : Nombre d’études (Essais), Rôle d'entrée, Nombre de répétitions.

Paramètres de la disposition : Nombre total de colonnes du champ, pourcentage de parcelles témoins

Utilisation : Ce dispositif est souvent utilisé en début de génération, lorsque les semences ou les ressources sont limitées et que l'utilisateur souhaite évaluer le plus grand nombre possible de génotypes.

Dispositif partiellement répété

P-Rep

Un cas particulier de dispositif augmenté où 20 % des entrées de test sont répétées, les entrées témoins ne sont pas classées comme spatiales ou répétées et aucune parcelle diagonale n'est incluse.

Paramètres de la conception : Nombre d’études (Essais), Nombre de répétitions.

Paramètres de la disposition : Nombre total de rangées du champ, ordre du champ (colonne en serpentin, ordre des colonnes, rangées en serpentin ou ordre des rangées)

Utilisation : Ce dispositif est souvent utilisé en début de génération, lorsque les semences ou les ressources sont limitées, lorsque l'utilisateur souhaite évaluer autant de génotypes que possible et lorsqu'il est difficile de maintenir des blocs homogènes lors de la comparaison de nombreux génotypes.

Dispositif en blocs incomplets

Bloc incomplet | OFT

Un type de dispositif en blocs incomplets irrésoluble, dans lequel tous les traitements ne sont pas testés dans le même bloc. Il s'agit d'un dispositif irrésoluble car les blocs ne peuvent pas être disposés et regroupés pour former des répétitions complètes.

Paramètres de la conception : Nombre de champs (études ou essais), nombre de répétitions, nombre de blocs.

Utilisation : Lorsque le nombre de traitements testés (entrées, génotypes) est très important, il est difficile d'avoir un champ uniforme qui puisse supporter ce grand nombre de parcelles, nous construisons alors de petits blocs (blocs incomplets). La taille du bloc ne doit pas être importante, même lorsque le nombre de traitements est élevé.

Note : Cette mise en œuvre est exclusive aux expérimentations de la phase d'essai au champ où chaque bloc est affecté à une étude. Il y a une restriction dans le nombre de blocs puisqu'il doit être divisible par le nombre d'entrées et aussi une restriction pour garantir un dispositif équilibré. Pas d'option pour définir la forme du champ.

Alpha Lattice

 

Le nombre d'entrées ne doit pas être un nombre premier.

Paramètres de la conception

  • No. Of Occurrences: Nombre d'emplacements où l'expérimentation sera plantée. La valeur par défaut est 1 et la valeur valide est supérieure ou égale à 1.

  • No. Of Replicates: Le nombre de répétitions. La valeur par défaut est 2 et la valeur valide est supérieure ou égale à 2.

  • No. Of Blocks Per Rep: Le nombre de blocs par répétition. Les valeurs possibles sont générées par le système et doivent être un facteur du nombre total d'entrées, à l'exception de 1 et du nombre total d'entrées, puisque le nombre d'entrées sera divisé par le nombre de blocs par répétition pour définir la taille du bloc (nombre de parcelles par bloc).

Paramètres de la disposition du champ

  • No. Of Rows Per Block : Utilisé pour définir la forme de chaque bloc. Doit être un facteur de la taille du bloc, puisque le modèle requiert des blocs rectangulaires. Par exemple, si le nombre d'entrées est 25, le nombre de blocs par rép. est 5, les options de rangées par bloc seulement seront 1 ou 5, c'est-à-dire que le bloc est une "barre verticale" de 5 parcelles ou une "barre horizontale" de 5 parcelles.

  • No. Of Rows Per Rep: Utilisé pour définir la forme de la répétition, ou, comment assembler les blocs, si côte à côte ou l'un devant l'autre dans le champ.

  • Rows: Utilisé pour définir la forme de l'essai au champ, en utilisant la même logique que le nombre de rangées par répétition, l'utilisateur peut définir comment les répétitions seront positionnées dans le champ. La restriction est de toujours générer un champ de forme rectangulaire.

  • Field Order: Décrit comment les parcelles seront attribuées dans le champ. Il peut s'agir d'une colonne en serpentin, d'une colonne en ordre, d'une rangée en serpentin ou d'une rangée en ordre.

Alpha-Lattice | CIMMYT

 

Le nombre d'entrées ne doit pas être un nombre premier.

Paramètre de la conception

  • No. Of Occurrences: Nombre d'emplacements où l'expérimentation sera plantée. La valeur par défaut est 1 et la valeur valide est supérieure ou égale à 1.

  • No. Of Replicates: Le nombre de répétions. La valeur par défaut est 2 et la valeur valide est supérieure ou égale à 2.

  • No. Of Plots Per Block: C’est la taille du bloc. Doit être un facteur du nombre d'entrées.

Paramètres de la disposition du champ

  • Rows: Utilisé pour définir la forme de l'essai au champ, utilisé pour définir comment les rép. seraient positionnées dans le champ. Dans ce modèle, il est possible de générer des blocs non rectangulaires.

  • Field Order: Il existe deux options de serpentin, horizontal ou vertical, comme le montrent les flèches. Les parcelles seront assignées au champ en serpentin, la première parcelle sera toujours à la parcelle R1C1 (rangée 1 colonne 1), si le serpentin est vertical la deuxième parcelle sera positionnée à R2C1, si horizontal R1C2, c'est-à-dire, dans un cas la parcelle suivante est ajoutée dans la rangée suivante dans l'autre cas dans la colonne suivante.

  • Plots Until Turn The Serpentine: Les parcelles seront attribuées au champ en serpentin déterminera quand le processus d'ajout d'une parcelle passera à la colonne suivante (si serpentin vertical) ou à la ligne suivante (si serpentin horizontal).

Exemple de parcelles jusqu'à ce qu'on tourne le serpentin.

 

25 entrées, 5 rangées, serpentin horizontal et 5 ou 10 parcelles jusqu'à tourner le serpentin.

Dispositif IWIN

 

Le nombre d'entrées ne doit pas être un nombre premier.

Paramètres du dispositif

  • No. Of Occurrences: Nombre d'emplacements où l'expérimentation sera plantée. La valeur par défaut est 1 et la valeur valide est supérieure ou égale à 1.

  • No. Of Replicates: Le nombre de répétitions. La valeur par défaut est 2 et la valeur valide est supérieure ou égale à 2.

  • No. Of Plots Per Block: C'est la taille du bloc. Doit être un facteur du nombre d'entrées.

  • Randomize the 1st Rep: La valeur par défaut (Yes) effectue une randomisation pour toutes les répétitions, l'alternative (NO) fixe la première répétition pour recevoir les entrées dans l'ordre où elles sont dans la liste des entrées, et les répétitions suivantes sont randomisées pour suivre la restriction Alpha-Lattice.

  • Randomize Each Occurrence: La valeur par défaut (Yes) exécute une randomisation pour chaque étude, l'alternative (NO), exécute une seule randomisation et réutilise le même résultat pour toutes les études.

Paramètres de la disposition du champ

  • Rows: Utilisé pour définir la forme de l'essai au champ, utilisé pour définir comment les rép. seraient positionnées dans le champ. Dans ce modèle, il est possible de générer des blocs non rectangulaires.

  • Field Order: Il y a deux options de serpentin, horizontal ou vertical, comme indiqué par les flèches. Les parcelles seront assignées au champ en serpentin, la première parcelle sera toujours à la parcelle R1C1 (rangée 1 colonne 1), si le serpentin est vertical la deuxième parcelle sera positionnée à R2C1, si horizontal R1C2, c'est-à-dire, dans un cas la parcelle suivante est ajoutée dans la rangée suivante, dans l'autre cas dans la colonne suivante.

  • Plots Until Turn The Serpentine: Les parcelles seront attribuées au champ en serpentin et cela déterminera quand le processus d'ajout d'une parcelle passera à la colonne suivante (si serpentin vertical) ou à la rangée suivante (si serpentin horizontal).

RCBD

 

Paramètres de la conception

  • No. Of Occurrences: Nombre d'emplacements où l'expérimentation sera plantée. La valeur par défaut est 1 et la valeur valide est supérieure ou égale à 1.

  • No. Of Replicates: Le nombre de répétitions. La valeur par défaut est 2 et la valeur valide est supérieure ou égale à 2.

Paramètres de la disposition du champ

  • No. Of Rows Per Rep: Utilisé pour définir la forme des répétitions, si elles sont côte à côte ou l'une devant l'autre dans le champ.

  • Rows: Utilisé pour définir la forme de l'essai au champ, en utilisant la même logique que No. Of Rows per Rep, l'utilisateur peut définir comment les répétitions seront positionnées dans le champ. La restriction est qu'il génère toujours une forme de champ rectangulaire.

  • Field Order: Décrit comment les parcelles seront assignées dans le champ. Il peut s'agir de colonnes en serpentin, de colonnes en ordre, de rangées en serpentin ou de rangées en ordre.

RCBD | CIMMYT

 

Paramètres de la conception

  • No. Of Occurrences: Nombre d'emplacements où l'expérimentation sera plantée. La valeur par défaut est 1 et la valeur valide est supérieure ou égale à 1.

  • No. Of Replicates: Le nombre de répétitions. La valeur par défaut est 2 et la valeur valide est supérieure ou égale à 2.

Paramètres de la disposition du champ

  • Rows: Utilisé pour définir la forme de l'essai dans le champ, utilisé pour définir comment les répétitions seraient positionnées dans le terrain.

  • Field Order: Il y a deux options de serpentin, horizontal ou vertical, comme indiqué par les flèches. Les parcelles seront assignées au champ en serpentin, la première parcelle sera toujours à la parcelle R1C1 (rangée 1 colonne 1), si le serpentin est vertical la deuxième parcelle sera positionnée à R2C1, si horizontal R1C2, c'est-à-dire, dans un cas la parcelle suivante est ajoutée dans la rangée suivante dans l'autre cas dans la colonne suivante.

  • Plots Until Turn The Serpentine: Les parcelles seront attribuées au champ en serpentin et cela déterminera quand le processus d'ajout d'une parcelle passera à la colonne suivante (si serpentin vertical) ou à la rangée suivante (si serpentin horizontal).

RCBD | OFT

 

Nécessite au moins 2 entrées de témoins et au moins 3 entrées de tests.

Paramètres de la conception

No. Of Farms: Nombre de blocs ou de champs où l'expérimentation sera plantée. La valeur par défaut est 10 et la valeur valide est supérieure ou égale à 10.

Rangée-Colonne

 

Le nombre d'entrées ne doit pas être un nombre premier.

Paramètres de la conception

  • No. Of Occurrences: Nombre d'emplacements où l'expérimentation sera plantée. La valeur par défaut est 1 et la valeur valide est supérieure ou égale à 1.

  • No. Of Replicates: Le nombre de répétitions. La valeur par défaut est 2 et la valeur valide est supérieure ou égale à 2.

  • No. Of Row Blocks: Le nombre de blocs de rangées. Doit être un facteur du nombre d'entrées sauf 1 et du nombre d'entrées.

Paramètres de la disposition du champ

  • Rows: Utilisé pour définir la forme de l'essai au champ, l'utilisateur peut définir comment les répétitions seront positionnées dans le champ. La restriction est de toujours générer une forme de champ rectangulaire.

  • Field Order: Décrit comment les parcelles seront assignées dans le champ. Il peut s'agir de colonnes en serpentin, de colonnes en ordre, de rangées en serpentin ou de rangées en ordre.

RCB augmenté

 

Paramètres de la conception

  • No. Of Occurrences: Nombre d'emplacements où l'expérimentation sera plantée. La valeur par défaut est 1 et la valeur valide est supérieure ou égale à 1.

  • No. Of Replicates: Le nombre de blocs. La valeur par défaut est 2. Doit être suffisant pour obtenir une erreur minimale de 12 degrés de liberté pour les entrées témoins. Doit être un facteur du nombre d'entrées de test. Le nombre d'entrées de test sera divisé par le nombre de répétitions. Chaque bloc recevra un ensemble complet d'entrées témoins et une partie des entrées de test égale au nombre d'entrées de test divisé par le nombre de répétitions.

Paramètres de la disposition du champ

  • No. Of Rows per Rep: Utilisé pour définir la forme des répétitions, si elles sont côte à côte ou l'une devant l'autre dans le champ.

  • Rows: Utilisé pour définir la forme de l'essai au champ, en utilisant la même logique que No. Of Rows per Rep, l'utilisateur peut définir comment les répétitions seront positionnées dans le champ. La restriction est de toujours générer un champ de forme rectangulaire.

  • Field Order: Décrit comment les parcelles seront assignées dans le champ. Il peut s'agir de colonnes en serpentin, de colonnes en ordre, de rangées en serpentin ou de rangées en ordre.

P-rep CRD avec des témoins systématiques diagonaux

 

Il faut avoir au moins 2 entrées témoins et plus de 50 entrées tests.

Paramètres de la conception

  • Entry Role: Identifier le rôle de chaque témoin, qu'il s'agisse d'un témoin spatial ou d'un témoin répété. La valeur par défaut est le témoin spatial.

  • No. of Reps: Le nombre minimum de répétitions et sa valeur par défaut est 2.

  • No. Of Occurrences: Nombre d'emplacements où l'expérimentation sera plantée. La valeur par défaut est 1 et la valeur valide est supérieure ou égale à 1.

Paramètres de la disposition du champ

  • Columns: Utilisé pour définir la forme de l'essai dans le champ. La valeur par défaut est 20 et la valeur minimale est 10.

  • Percentage of Check Plots: Permet de définir le nombre de parcelles qu'occupera le témoin spatial diagonal. La valeur par défaut est 10, la valeur minimale est 5 et la valeur maximale est 20.

Dispositif partiellement répété

 

Paramètres de la conception

  • Specify Groups

    • Group type: Identifie les différents groupes témoins et tests.

    • No. Of Replicates: Pour le groupe témoin, le nombre minimum est de 2. Pour le groupe test, au moins 20 % des entrées de test sont répétées.

  • No. Of Occurrences: Nombre d'emplacements où l'expérimentation sera plantée. La valeur par défaut est 1 et la valeur valide est supérieure ou égale à 1.

Paramètres de la disposition du champ

  • Rows: Utilisé pour définir la forme de l'essai au champ.

  • Field Order: Décrit comment les parcelles seront assignées dans le champ. Il peut s'agir de colonnes en serpentin, de colonnes en ordre, de rangées en serpentin ou de rangées en ordre.

Bloc incomplet | OFT

 

Paramètres de la conception

  • No. Of Farms: Nombre de blocs ou d'études où l'expérimentation sera plantée. La valeur par défaut est 100 et la valeur valide est supérieure ou égale à 60.

  • No. Of Plots Per Farm: Il s'agit de la taille du bloc ou du nombre de parcelles par champ. Doit être un facteur du nombre d'entrées.