BA Etapa 8

Trabajos pendientes para nuevas solicitudes.

En la columna Trabajos, las solicitudes de análisis recién creadas ahora están marcadas con PENDING para indicar que aún no tienen trabajos. Anteriormente, la etiqueta predeterminada en la columna Trabajos era "Único" o Múltiple" para dar una idea sobre la cantidad de trabajos creados para una solicitud..

Color-coding of trait data is now consistent with Core Breeding tools and PDM.

When viewing () the job outputs for a request, the color coding of data is now standardized with PDM and Core Breeding’s Experiment Manager and Data Collection tools. Possible outliers are highlighted in light orange, while suppressed ones are in gray.

La codificación por colores de los datos de las variables ahora es consistente con las herramientas Centro de Mejoramiento y ARM.

En la tabla de variables, la codificación de colores de los datos de variables ahora está estandarizada con las herramientas de recopilación de datos y administrador de experimentos de ARM y Centro de Mejoramiento. Las celdas con posibles valores atípicos se resaltan en naranja claro, mientras que las que se han suprimido y malas están en gris y rojo, respectivamente. Los datos buenos y cuestionables se muestran sin color, mientras que los que faltan se resaltan en azul y se indican con "NA".

Errores resueltos

1. Ahora podrá ver correctamente la página de inicio de BA antes de iniciar sesión y al cerrar sesión y

2. Al seleccionar los nombres de las herramientas se resaltan en gris en el menú de navegación de la izquierda.

Se mejoró el menú de navegación izquierdo.

Para su comodidad, ahora podrá optar por tener el menú de navegación izquierdo siempre abierto. Para hacer esto, simplemente expanda el menú de navegación izquierdo () y busque el botón > cerca de la parte inferior. De lo contrario, seleccione el botón < para ocultar el menú.

Se ha mejorado la selección de ocurrencias de experimentos para solicitudes de análisis de ocurrencia única (SOA).

Esta versión mejora los experimentos y ocurrencias enumeradas en la pestaña Experimentos. Específicamente, ahora podrá:

1. Seleccione ocurrencias usando un diseño no definido. Ahora podrá utilizar ocurrencias de experimentos de Ensayos de Mejoramineto utilizando un diseño No definindo para crear una solicitud SOA. Desde el navegador de datos ARM, solicite una SOA. Seleccione la ocurrencia en la pestaña Experimentos y elija las variables para los que desea solicitar el análisis. Una vez hecho esto, seleccione Enviar Submit para enviar su solicitud. Espere los resultados monitoreando los estados de los trabajos en el navegador de datos de ARM.

2. Agregue más ocurrencias a su solicitud SOA. Esta característica le permitirá seleccionar ocurrencias en el mismo experimento y agregarlas a su solicitud SOA actual. Para hacer esto, verifique la calidad de sus datos de variables en PDM. Después de realizar una verificación de calidad (QC) de al menos un (1) variable en PDM, ahora podrá proceder a analizar su ocurrencia en ARM. Será dirigido a la pestaña Experimentos de ARM, donde se enumeran todas las ocurrencias de su experimento. Aquí, la ocurrencia actual ya está seleccionada, pero puede seleccionar más para incluirlas en su solicitud SOA actual.

Se ha mejorado la selección de trabajos para solicitudes de análisis de múltiples ocurrencias (MOA).

Como preparación para admitir solicitudes de MOA pronto, ahora se presenta una mejor visualización de todos los trabajos FINALIZED en la pestaña Experimentos. Desde el navegador de datos de ARM, solicite un MOA. Los ID de trabajo para cada variable analizada ahora se encontrarán en un menú desplegable. Seleccione los trabajos que analizan la misma variable de al menos dos (2) ocurrencias diferentes. Podrá anular la selección de un trabajo para una variable eligiendo la opción “---”. Además, se mostrará información sobre las herramientas cuando pase el cursor sobre cada trabajo. Esto mostrará la fecha y hora en que finalizó el trabajo.

Errores resueltos

No encontrará errores al:

1. Filtrar en el navegador en la pestaña de experimentos de SOA y MOA en lay expandir cada experimento para mostrar ocurrencias y

2. Al anular el último trabajo en una solicitud, lo que lo redireccionará automáticamente al navegador de datos ARM.

Se mejoró la administración de ocurrencias.

Esta versión resuelve las limitaciones del navegador de datos PDM citadas en la versión 23.09. Específicamente, ahora podrá:

1. Explora más ocurrencias. Ahora puede explorar todos las ocurrencias de experimentos Ensayos de Mejoramiento (BT) en el navegador de datos de PDM. También podrá navegar por la lista fácilmente utilizando la función de paginación y filtro. Anteriormente, sólo había cien registros disponibles en el navegador.

2. Reflejará inmediatamente las variables QCed (Control de calidad realizado). En la tabla de variables, ahora podrá esperar que las columnas de variables con control de calidad (QCed) se resalten fácilmente en verde. Seleccion el icono guardar () en la barra de herramientas y seleccione las variables como QCed. Finalmente, guarde Save la transacción.

3. Seleccione ocurrencias usando un diseño no definido. Los experimentos de BT que utilizan un diseño no definido ahora se incluirán en las ocurrencias disponibles para su selección en el navegador de datos de PDM. Desde el navegador de datos de PDM, Explore la calidad de los datos de las variables de las ocurrencias utilizando un diseño No específico.

Errores resueltos

 Los errores reportados se han solucionado. Lo siguiente ahora funciona como se esperaba:

1. El mapa de calor se grafica usando los valores del arreglo de siembra X e Y (PA X, PA Y).

2. Se Reflejarán nuevos datos de variables en la Tabla de variables y en la caja de Lista de variables después de actualizar sus datos de variables a la última versión disponible del Centro de Mejormiento.

Visualice los resultados de las solicitudes de genotipeo.

La herramienta de análisis de datos moleculares (MDA) implementa flujos de trabajo analíticos clave para análisis moleculares respaldados por EBS. En esta versión, el navegador de datos de la MDA enumera todas las solicitudes de genotipeo cuyos resultados están listos para ser vistos () y descargados (). El navegador de datos obtiene todas las solicitudes de genotipeo con el estado RESULT READY de la herramienta Administrador de solicitudes del dominio de Administrador de Servicios.

Las Pruebas dispersas ahora estarán disponibles.

Las pruebas dispersas permiten que las entradas de evalucaión se distribuyan aleatoriamente en diferentes ocurrencias. A partir de esta versión, ahora podrá utilizar las pruebas dispersas para el diseño de prueba parcialmente replicado (P-Rep) en la herramienta de creación de experimentos del Centro de Mejoramiento para experimentos de Ensayos de Mejoramiento.

Una nueva página de accesos esta disponible.

Ahora podrá iniciar sesión en el dominio de Análisis de Mejoramiento (BA) utilizando la nueva página de inicio de sesión. Simplemente acceda al dominio BA a través del ícono de Accesos directos de dominio () o usando un enlace. Un mensaje de bienvenida, una breve descripción del dominio y su versión actual aparecerán en la página de inicio de sesión.

Ahora se admitirán solicitudes de análisis para múltiples ocurrencias (MOA).

El menú desplegable Solicitar análisis Request Analysis incluirá la opción de solicitar MOA. Se presentan los siguientes:

1. Pestaña Experimentos. Esto enumera todas las solicitudes cerradas de análisis de ocurrencia única (SOA) que podrá seleccionar. El navegador de datos también muestra los ID de trabajo para cada varaible analizada. Para continuar con la solicitud de MOA, deberá elegir la misma variable de almenos dos (2) ocurrencias diferentes para su análisis. Al hacerlo, se habilitará el botón Siguiente Next.

2. Pestaña de opciones. Esto le permitirá extraer los BLUEs y las métricas de análisis en formato CSV. En esta versión, la descarga del BLUPs estará deshabilitada. Seleccione el botón Enviar Submit para comenzar a descargar el archivo zip que contiene los archivos de métricas y predicciones en su dispositivo.

Se mejoró la administración de solicitudes de análisis de ocurrencia única (SOA).

Esta versión mejora la experiencia del usuario en términos de gestión de trabajos en solicitudes SOA. Las siguientes mejoras se analizan a continuación.

1. Visualizar los ID de los trabajos. Desde el navegador de datos ARM, abra una solicitud SOA seleccionando el icono ver (). En la tabla Lista de trabajos, ahora se asignarán los ID de trabajo para cada trabajo de análisis para una identificación más sencilla. El ID del trabajo es un código generado por el sistema que consta del prefijo 'J', seguido de una secuencia númerica.

2. Acceso restringido a trabajo con estado VOIDED o FINALIZED. Al eligir Anular Void un trabajo en una solicitud SOA, el sistema ahora deshabilitará el acceso a él. Además, el sistema desactivará todos los botones para trabajos finalizados Finalized, excepto el botón de filtro (). Esto evitará que se realicen más cambios en los datos.

Errores resueltos

Los errores reportados se han solucionado. Lo siguiente ahora funciona como se esperaba:

1. En la pestaña Experimento, el botón Seleccionar todo se deseleccionara automáticamente cuando anule la selección de al menos una (1) ocurrencia.

2. Los trabajos ahora se procesan en consecuencia y

3. El estado de CANCELED de la solicitud se mostrará correctamente cuando todos los trabajos tienen el estado VOID o ERROR.

 Ahora se podrán cargar datos actualizados de las variables.

Aparecerá un nuevo botón Check for Updates en la tabla de variables. Esto le permitirá trabajar en la última versión de sus datos de las variables, que el sistema obtiene del dominio Centro de Mejoramiento. Después de seleccionar el botón, se le informará si los datos de la variable en el que está trabajando estan actualizados Up to Date. De lo contrario, el botón le pedirá que actualice la transacción Update the Transaction. La coherencia de los datos de variables en las estadísticas y tablas de variables se mejorará aún más en las próximas versiones.

Se mejoró la administración de los datos de las variables.

1. Suprima los valores en la pestaña Diagrama de caja. Ahora podrá definir los valores que se suprimirán a medida que los datos de variables se visualizan en un gráfico diagrama de caja. Seleccione un variable y luego genere Generate el gráfico diagrama de caja. Se mostrará la nueva sección Suprimir valores atípicos, donde podrá definir a) el límite superior y b) los valores atípicos de la variable del límite inferior para suprimir. El primero suprime todos los posibles valores atípicos de esa variable que es mayor o igual al valor identificado, mientras que el segundo suprime todos los posibles valores atípicos de esa variable que es menor o igual al valor proporcionado. Seleccione el botón Suprimir para aplicar los cambios al gráfico diagrama de caja y a la tabla de variables.

2. Reflejar columnas con control de calidad (QC). Todas las columnas de datos de las variables que cuenten con QC estarán resaltadas en verde, lo que refleja correctamente cada vez que se abre una nueva transacción.

Errores resueltos

No encontrará errores al abrir y crear una nueva transacción.

Se está trabajando en las bases para realizar pruebas dispersas.

Las pruebas dispersas permitirán que las entradas de prueba se distribuyan aleatoriamente en diferentes ocurrencias. Se están realizando desarrollos de backend para permitir y respaldar pruebas dispersas en la herramienta de creación de experimentos del Centro de Mejoramiento.

Se mejoró el Administrador de solicitudes de análisis de ocurrencia única (SOA).

Esta versión mejora la experiencia del usuario en términos de Administrar solicitudes y resultados SOA. Específicamente, ahora podrá:

1. Mostrar los resultados del primer trabajo con un estado READY. Desde el navegador de ARM, seleccione el ícono de vista () al lado del nombre de la solicitud. Esto le redireccionará a la página del visor de resultados del análisis, donde se mostrarán inmediatamente los resultados del primer trabajo READY. Si no hay ninguno, se muestra el siguiente trabajo con un estado FINALIZED.

2. Vuelva al navegador ARM. Se habilitará un nuevo botón Atrás en la página del visor de resultados del análisis, por lo que podrá ser redirigido al navegador de datos ARM.

3. Finalice y continúe con el trabajo siguiente. Cuando Finalice un trabajo, el siguiente READY trabajo se cargará automáticamente. Después de finalizar todos los trabajos en una solicitud, se le solicitará que permanezca en la página del visor de resultados del análisis o que regrese al explorador de datos de ARM.

4. Administre fácilmente sus resultados. En la pestaña Tabla de residuales, un nuevo botón de filtro () le permitirá mostrar a) solo valores atípicos posibles, b) solo datos supresos, o c) ambos. El nuevo botón Editar también le permitirá 1) suprimir todos los posibles valores atípicos o 2) suprimir todos los datos puntuales seleccionados.

Errores resueltos

No encontrará errores al anular un trabajo en una solicitud de análisis

Explore ocurrencias desde el navegador del PDM.

Ahora podrá acceder a las ocurrencias directamente desde el navegador del PDM, para que pueda verificar fácilmente la calidad de sus datos. Las ocurrencias enumeradas en el navegador se limitarán a experimentos de tipo Ensayos de Mejoramiento (BT) con un estado de TRAIT DATA COLLECTED, que son los mismos requisitos cuando se utiliza el Administrador de Experimentos como punto de entrada al PDM. En esta versión, sólo se muestran los primeros 100 registros en el navegador. Esta versión también excluye los experimentos de BT que utilizan la etapa de On-Farm Trail y un diseño no definido.

 Inicie sesión en el dominio de Análisis de mejoramiento utilizando las credenciales de su institución. Abra el menú de navegación izquierdo y elija PDM. Desde el navegador, busque su experimento y seleccione el ícono de expandir (>). Luego, seleccione una ocurrencia y seleccione en Explorar para comenzar a evaluar los datos de sus variables.

Vea el ensayo a auditar (QC) para los datos de las variables.

Un ensayo a auditar es una lista de cambios realizados en el código de control de calidad (QC) de los datos. Esto le permitirá ver un historial de ediciones que contiene detalles sobre quién realizó los cambios y cuándo, siempre que estos cambios se hayan guardado. Esta característica está disponible en la tabla de variables. Simplemente haga clic derecho en una celda y elija mostrar el historial de edición. La pequeña ventana emergente mostrará el cambio más reciente en los datos. También mostrará cuántos cambios se han realizado en total. Podrá mostrar cada cambio utilizando los iconos de navegación de página (< y >).

Se mejoró la administración y visualización de datos.

Se implementarón las siguientes características para esta versión:

1. Cambie el código de control de calidad por variable. Esta opción le permitirá actualizar los códigos de control de calidad de los datos de las variables de forma múltiple. Desde el botón Editar, elija cambiar el código de control de calidad por Variable. Esto abrirá una ventana modal, donde podrá elegir la Variable y luego el código de control de calidad que desea aplicar al conjunto de datos. Luego, una notificación confirma los cambios aplicados en la tabla de variables. Seleccione el ícono de actualización () en las tablas de estadísticas y variables para actualizar los valores.

2. Los mapas de calor ahora utilizarán los valores X y Y del área de siembra (PA). Al visualizar la magnitud de las parcelas de las ocurrencas y los datos de las variables en la pestaña Mapas de calor, los valores PA X y PA Y ahora se usarán en el gráfico. Anteriormente, utilizaba los valores del Campo X y del Campo Y.

Errores resueltos

Los errores reportados se han solucionado. Lo siguientes ahora funcionan como se esperaba:

1. En la tabla de variables, los cambios en los códigos de control de calidad ahora será reflejado inmediatamente en los datos y en términos del color de fondo de la celda.

2. En la tabla de estadísticas, los valores incorrectos ahora se excluyen correctamente en el cálculo del número de valores válidos

Se ha habilitado una nueva función de descarga.

La herramienta de análisis de datos moleculares (MDA) implementa flujos de trabajo analíticos clave para análisis moleculares respaldados por EBS. Tras su lanzamiento en julio de 2023, la herramienta se ha mejorado con un nuevo icono de descarga ) que se encuentra en la barra de herramientas del navegador de datos de MDA. Tendrá la opcion de:

1. Descargar los datos actuales de la solicitud de genotipeo. Esta opción le permitirá exportar los datos que se muestran actualmente en el navegador. Como tal, puede personalizar los datos mostrados usando filtros y el botón de control de página. Después de la descarga, se guarda un archivo CSV en su dispositivo.

2. Descargar datos de la solicitud de genotipeo limpios. Esta opción le permitirá exportar solo los datos de genotipeo limpios, que incluyen a) muestras con datos faltantes inferiores o iguales al 5 %, y b) marcadores con una tasa de llamada de al menos el 95 %. Después de la descarga, se guarda un archivo CSV en su dispositivo.

3. Descargar todos los datos de la solicitud de genotipeo. Esta opción le permitirá exportar los datos completos del genotipeo disponibles para una solicitud. Luego se guarda un archivo XLS en su dispositivo.

Se están creando las bases para realizar pruebas de dispersión.

Las pruebas de dispersión le permitirá que las entradas de prueba se distribuyan aleatoriamente en diferentes ocurrencias. Se están realizando desarrollos de backend para permitir y respaldar pruebas de dispersión en la herramienta de creación de experimentos del Centro de Mejoramiento.

La página se recarga automáticamente después de seleccionar un nuevo programa.

Un filtro de programa está disponible en la barra de menú del dominio. Al seleccionar un programa, se le indica al dominio que desea ver y acceder solo a los experimentos, ocurrencias y datos de ese programa. Cuando desee cambiar a un programa diferente, la página se recargará para actualizar los navegadores y mostrar solo los datos que contiene. Esta función está disponible para las herramientas PDM y MDA.