BA Etapa 7
- Stephanie Edora Manrilla
- Mijail Javier
La página de inicio en el dominio de EBS mostrará la versión del software disponible para los usuarios. Esto también es visible en el menú de navegación izquierdo. Cada versión resaltará nuevas funciones clave, mejoras, correcciones de errores o las tres. Podrá consultar las notas a continuación para obtener más información de cada versión.
Versión 23.08.30
La salida del trabajo de Predicciones BLUEs ya está disponible.
Ahora se podrá generar una visualización mejorada de Heatmaps donde los bordes están mejor definidos.
Las columnas de datos en la pestaña Parámetros de análisis ahora siguen el formato de script R.
Los resultados de este trabajo también se incluyen en el informe de análisis descargable
Se han resuelto las fallas que causaban errores en el procesamiento de trabajos, la generación de informes y la visualización de datos de efectos de genotipo.
Está disponible una visualización mejorada de Heatmaps.
No encontrará error al generar estos gráficos para sus ocurrencias.
El contenido de la ventana modal Guardar transacción ahora se mostrará correctamente.
Se realizaron cambios en la API para mejorar el rendimiento.
En el backend se habilitó el filtrado de diseños aplicables para Ensayos On-Farm.
Esta mejora se integrará pronto en el dominio Centro de Mejoramiento.
Se ha solucionado el error que provocaba que se generaran archivos de entrada y salida a pesar de que un archivo de diseño cargado no superaba la validación.
No encontrará ningún error al descargar informes de análisis desde el Administrador de Solicitudes de Análisis.
Ahora puede acceder a la nueva página Breeding Analytics a través del Portal EBS.
Podrá continuar a iniciar sesión en el dominio nuevamente después de haber expirado la sesión.
Versión 23.06.29
Solo los experimentos Ensayos de Mejoramiento y Ocurrencias cuyos datos de variables hayan sido sometidos a controles de calidad en la herramienta Administrador de datos fenotípicos.
La herramienta puede analizar ocurrencias utilizando RCBD, RCBD aumentado, Alpha Lattice, Row-Column, P-REP y Diseños Aumentados.
En la subpestaña de la tabla de residuos, los posibles valores atípicos en la columna RESID.BLUEs ahora se resaltan en Rojo red.
Podrá suprimir estos valores haciendo clic derecho en la celda y eligiendo la opción suprimir. Los valores suprimidos se resaltarán en Gris gray.
A continuación, podrá volver a analizar los datos de las variables después de suprimir los valores que no deberían incluirse en el análisis.
Los resultados de los trabajos de los Parámetros de análisis, Gráficos residuales y Mapas de calor ahora estarán disponibles.
Los parámetros de análisis incluyen el nombre del experimento, el nombre de la ocurrencia, el efecto del genotipo, la variable, algunas estadísticas descriptivas, CV y heredabilidad han sido provistos.
A partir de esta versión, solo se admitirá un histograma (recuento x residuos) para la pestaña de gráficos de residuos.
Se generará un mapa de calor solo para ocurrencias con coordenadas de siembra (PA X y PA Y). De lo contrario, se mostrará un mensaje de advertencia.
Después de revisar los resultados del trabajo para sus datos, podrá finalizar los resultados.
Al finalizar sus datos, se desactivarán los botones nuevos Vacío void y REANALIZAR reanalyze.
El estado de la solicitud se establecerá en Cerrado closed cuando al menos un trabajo se haya finalizado y ningún otro trabajo tenga el estado de Procesando processing o Listo ready.
El estado Cerrado closed de una solicitud habilita la función de descargar informe a través del icono en el navegador de datos.
El navegador de datos también se mejoró con las siguientes funciones:
proporcionó convenciones de nomenclatura generadas por el sistema para diferentes tipos de solicitudes de análisis en función de la cantidad de experimentos, ocurrencias y rasgos y
restringida visualización () de solicitudes a menos que tenga un estado de Listo ready.
La implementación de Análisis Operacionales - Fase 1 continua.
Los desarrollos de back-end se han implementado continuamente para refactorizar el marco del análisis.
Ahora se requerirá confirme que ha verificado la calidad de los datos para cada variable antes de que se puedan usar para el análisis.
Aparecerá una ventana modal cuando guarde () los cambios realizados en los datos de las variables.
Guardar convierte cualquier dato marcado como 'cuestionable' en 'bueno'.
También puede agregar notas en la ventana modal.
Cuando se haya verificado la calidad de al menos un dato de la variable, se mostrará el estado de la ocurrencia Calidad de Datos de Variables Comprobada trait data quality checked en la herramienta Administrador de Experimentos del Centro de Mejoramiento.
Los cambios en los datos de variables también se reflejan en la subpestaña Parcela del Administrador de experimentos.
Los cuadros de las listas de variables mostrarán el icono después de que se haya verificado la calidad de la variable.
El nuevo botón de análisis estará habilitado para ocurrencias de Ensayos de Mejoramiento con el estado Calidad de Datos de Variables Comprobadas trait data quality checked.
Esto lo redirigirá a la herramienta Administrador de solicitudes de análisis para que pueda continuar con la solicitud.
Se generará un mapa de calor solo para ocurrencias con coordenadas de siembra (PA X y PA Y). De lo contrario, se mostrará un mensaje de advertencia.
Se realizaron mejoras para garantizar que la posición de la tabla de variables y la tabla de estadísticas sea fija en el navegador de datos.
Los cambios en el estado de control de calidad de los datos de las variables se documentan en el backend utilizando la nueva base de datos Análisis de Mejoramiento.
Se puede esperar un mejor rendimiento del sistema cuando agregue una ocurrencia a los experimentos de Ensayos de Mejoramiento que utilizan el diseño RCBD y Ensayos On-Farm (OFT) a través de la herramienta Administrador de experimentos de Centro de Mejoramiento.
Las reglas de validación para los archivos de aleatorización de P-Rep cargados se actualizaron para eliminar la regla que exige que se replique al menos el 20 % de las entradas de prueba.
El marco de diseño refactorizado ahora admitirá el procesamiento de solicitudes de diseño de carga y la generación de gráficos para experimentos y ocurrencias del dominio Centro de Mejoramiento.
No encontrará errores al generar aleatorizaciones utilizando el diseño Alpha Lattice para sus experimento.
Se están realizando desarrollos internos para conectar al Centro de Mejoramiento del EBS con QBMS utilizando Breeding API (BrAPI) para fines de análisis de datos.
Un filtro de programa ahora está configurado en el dominio de Análisis de Mejoramiento.
Esto limita las solicitudes de análisis y las ocurrencias enumeradas al programa seleccionado.
Las opciones forman parte de todos los programas en los que es miembro.
De forma predeterminada, la herramienta utiliza su último programa seleccionado o el primer programa que se guardó en su perfil de usuario de EBS.
La versión de la herramienta Administrador de solicitudes de análisis se muestra en la esquina inferior izquierda de la página.
Versión 23.05.31
Ahora se podrá acceder a una interfaz de navegador de datos mejorada.
Podrá crear una solicitud de análisis de ocurrencia única para experimentos de prueba de reproducción utilizando el diseño RCBD.
Se analizará una variable para cada solicitud de análisis.
Se admitirán los siguientes estados: BORRADOR, ABIERTO, CANCELADO y CERRADO.
También se habilita un estado de trabajo de contraparte: PROCESANDO, LISTO, ERROR, VACIO y FINALIZADO.
Una vez LISTO, los resultados de sus solicitudes de análisis ahora también se podrán ver () en la herramienta.
Esto es compatible con las funcionalidades básicas del navegador, como ordenar, filtrar y navegar por la página.
Se produce la salida del trabajo residual.csv.
Otros resultados de trabajo estarán disponibles en la próxima versión de la herramienta.
La implementación de Operational Analytics - Fase 1 ha continuado.
Los desarrollos de back-end se implementaron continuamente para refactorizar el marco de análisis.
La magnitud de la información básica de la parcela y los datos de las variables ahora se podrá visualizar mediante Mapas de Calor.
Los datos se podrán colorear por variable, bloque, repetición, entrada y tipo de entrada.
Al colorear los datos por variable, se mostrará una lista de variables que le permitirá definir la variable.
El nombre de la variable se usa para etiquetar el gráfico.
Tras la generación del mapa de calor, también se mostrará una leyenda al lado del gráfico.
Podrá eliminar las selecciones anteriores utilizando Borrar.
La relación entre dos rasgos ahora también se podrá generar mediante Diagramas de Dispersión.
También se podrá configurar un cuadro de lista de variables para este gráfico.
Se deben seleccionar al menos dos variables para generar el gráfico.
Podrá eliminar las variables seleccionadas anteriormente utilizando el botón Borrar.
Los Diagramas de Caja ahora tienen una visualización mejorada que muestra los valores atípicos
Los desarrollos de back-end están en desarrollo para la función de cargar archivos de resultados aleatorios que se generaron fuera de EBS a través de la herramienta de creación de experimentos del Centro de Mejoramiento.
Las reglas de validación también se revisaron para admitir esta característica.
Los parámetros de diseño de RCBD también se configuraron en la nueva base de datos.
Se integraron nuevos puntos finales de API para admitir Análisis Operational - Fase 1.
Versión 23.04.26
Se han estado realizando mejoras internas para preparar la nueva base de datos de la herramienta de análisis y su interfaz de usuario.
Las pestañas Tabla, Diagrama de caja e Histograma ahora están más reconocibles como pestañas separadas y podrá seleccionarlas.
La pestaña Tabla se mejoró mediante los siguientes cambios:
La pestaña ahora está correctamente dividida en dos secciones: las Estadísticas y la Tabla de Variables.
Para una referencia más sencilla, el nombre de la ocurrencia se muestra junto al nombre de la herramienta.
La clave de las columnas y celdas de la tabla de variables ahora se encuentra arriba de los botones de acción, como filtrar ( ) y guardar ( ), que también se han movido más cerca de la tabla de las variables.
Las opciones de control de calidad se muestran de una en una después de hacer clic con el botón derecho en una celda.
Las pestañas Diagrama de Caja e Histograma ahora tendrán una mejor visualización y facilidad de uso:
Las variables se enumerarán abajo para que pueda simplemente seleccionar una o más variables y posteriormente seleccionar el botón Generar.
También podrá revertir su selección usando el botón Borrar.
El tamaño de los gráficos generados también se minimizó para una visualización más eficiente.
Los gráficos se identificarán mediante el nombre de ocurrencia para el diagrama de caja, mientras que las abreviaturas de las variables se utilizan como etiquetas para los gráficos de histograma.
Ahora podrá realizar tareas de control de calidad en los datos de las variables de su gráfico utilizando los puntos finales de la API recientemente desarrollados.
La tabla de estadísticas ahora mostrará un mensaje adecuado en lugar de devolver un error
Se prepararon archivos de muestra para probar las reglas de validación al cargar archivos de resultados de aleatorización que no son compatibles con EBS.
Se están realizando desarrollos internos para preparar la nueva base de datos de diseño para su uso
Los requisitos básicos de recuperación de datos genotípicos y de control de calidad de datos básicos se documentaron como parte del desarrollo inicial de la herramienta
Los desarrollos de back-end están en progreso para conectar el Centro de Mejoramiento con QBMS utilizando las APIs de Mejoramiento (BrAPI) para fines de análisis de datos
Se realizaron pruebas de artillería para evaluar la arquitectura mejorada del dominio Análisis de Mejoramiento y garantizar que funcione como se espera.
Estas pruebas se documentan en consecuencia, incluido el estado de las pruebas para cada herramienta o cualidad.
Versión 23.03.29
Los datos numéricos de las variables fenotípicas de las parcelas ahora se podrán visualizar utilizando las pestañas de diagramas de caja e histograma.
El diagrama de caja muestra la distribución de los datos de características de la parcela, mientras que el histograma muestra la frecuencia de la distribución.
Las nuevas pestañas le permiten generar un diagrama de caja o histograma para cada variable que elija.
En la pestaña del diagrama de caja, podrá ver los detalles de los valores atípicos cuando pase el cursor sobre los puntos de los datos.
También podrá ajustar la configuración de la pantalla usando la barra del menú que se encuentra en la esquina superior derecha de cada gráfico.
Cada gráfico se puede descargar como un archivo PNG.
Los datos de las características de la parcela ahora se podrán marcar como cuestionables, buenos o malos definiéndolos con un clic derecho en cada celda.
Las celdas azules indicarán datos faltantes, mientras que las celdas con datos incorrectos usan un color de fuente rojo.
A medida que edite los datos de las variables de su parcela, se mostrará un mensaje de advertencia para recordarle los cambios no guardados.
La tabla de estadísticas también se actualizará una vez que se guarden los cambios
Los cálculos estadísticos mejorarán aún más cuando se:
excluyan de los datos supresos, y al
procesar correctamente los datos faltantes en ocurrencias con conjuntos de datos incompletos.
Ahora serán aceptados los archivos separados por punto y coma .CSV, cuando se carguen con resultados de aleatorización que se generen fuera del EBS.
Esto será compatible con la herramienta de creación de experimentos del dominio Centro de Mejoramiento.
Los desarrollos de back-end aún están en desarrollo para 1) descargar el archivo del arreglo del diseño y 2) cargar archivos de características de diseños no específicos.
Pronto estará disponible en la herramienta de creación de experimentos del dominio Centro de Mejoramiento.
Las reglas de validación ahora estarán documentadas para cargar archivos de resultados de aleatorización que no son compatibles con EBS.
Los desarrollos de back-end están en curso para la implementación de Análisis Operacional - Fase 1, que utilizará la nueva base de datos BA unificada y su arquitectura mejorada.
Version 23.02.28
El archivo de informe generado se actualizó para mostrar correctamente todas las ubicaciones en la hoja de informe Entrada x Ubicación.
Los valores faltantes de las variables ahora están codificados correctamente como "NA" en el archivo de informe generado.
Si tiene preguntas o sugerencias, haganos llegar un ticket a través del Escritorio de Servicio del EBS. ¡Esperamos con interés escuchar de usted!