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La página de inicio en el dominio de EBS mostrará la versión del software disponible para los usuarios. Esto también es visible en el menú de navegación izquierdo. Cada versión resaltará nuevas funciones clave, mejoras, correcciones de errores o las tres. Podrá consultar las notas a continuación para obtener más información de cada versión.

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2024 Trimestre 2

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La página de inicio en el dominio de EBS mostrará la versión del software disponible para los usuarios. Esto también es visible en el menú de navegación izquierdo. Cada versión resaltará nuevas funciones clave, mejoras, correcciones de errores o las tres. Podrá consultar las notas a continuación para obtener más información de cada versión.

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2024 Trimestre 4

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titleAdministrador de Solicitudes de Análisis (ARM)

Actualice el explorador de datos.

Un icono (blue star) de actualización le permitirá volver a cargar el explorador de datos para actualizar su contenido. En el ARM, el explorador de datos, esto le ayudará a ver el estado actualizado de sus solicitudes y sus trabajos, tanto para análisis de ocurrencia única (SOA) como para análisis de ocurrencia múltiple (MOA).

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Ver los errores de las solicitudes canceladas.

Para una mejor experiencia de usuario, ahora podrá visualizar un mensaje de error para las solicitudes de análisis que hayan sido

Status
colourRed
titlecanceled
, por lo que podrá revisar en consecuencia. Lo mismo se proporcionará para los trabajos de solicitudes que hayan encontraron un
Status
colourRed
titleerror
. Simplemente coloque el cursor sobre el estado para mostrar el mensaje de error

ARM2.gifImage Added

Envíe solicitudes de análisis a Bioflow.

Los resultados de las solicitudes de análisis creadas en ARM ahora se podrán enviar a Bioflow para análisis posteriores. Los usuarios aún podrán descargar una copia de los resultados en ARM a través del icono de descarga. Ambas funciones se habilitan tan pronto como la solicitud de análisis pasa al estado

Status
colourYellow
titleEXPORTED
.

image-20241126-081101.pngImage Added

Correciones

No encontrará problemas al utilizar los filtros del programa, de modo que solo las transacciones relevantes del programa seleccionado estén disponibles en los navegadores de datos.

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titleAdministrador de Datos Fenotípicos (PDM)

Ver comentarios de transacciones.

Los comentarios de transacción se crean para anotar cualquier detalle o cambio importante después de comprobar la calidad de los datos. Estos se pueden crear a través de la ventana modal que se abre (blue star) al guardar los cambios realizados en la tabla de variables. Coloca el cursor sobre el icono de nota (blue star) que se encuentra en la barra de herramientas de la tabla de características para mostrar los comentarios guardados.

image-20241107-051420.pngImage Added

Guarde las transacciones fácilmente.

Utilice la ventana modal mejorada al (blue star) guardar los cambios realizados en la Tabla de Variables. Está disponible una ventana modal de interfaz más sencilla y fácil de usar, que es posible gracias a la eliminación de la casilla de verificación Cerrar transacción. Anteriormente, marcar esta casilla de verificación le permitía al sistema cerrar la transacción sin guardar los cambios y volver a cargar la página para proporcionar los datos de ocurrencia actualizados de Core Breeding. En su lugar, podrá usar el botón Buscar actualizaciones en la barra de herramientas de la tabla de variables para el mismo propósito.

image-20241107-052040.pngImage Added

Recibirá notificaciones cuando ingrese a ocurrencias sin datos recopilados.

Ahora se muestrará inmediatamente una ventana modal cuando se abrá una ocurrencia sin datos de parcelas de variables recopiladas. El mensaje incluirá instrucciones sobre cómo solucionar el problema. Esta ventana modal también se puede mostrar seleccionando el hipervínculo en el mensaje de advertencia junto al nombre de la herramienta

Image Added

Correcciones

No encontrará errores al buscar ocurrencias para explorar.

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titleStatistical Design Models (SDM)

Se actualizaron las definiciones de diseño.

Se implementarón las definiciones de diseño actualizadas para los siguientes diseños:

  1. Alpha-Lattice,

  2. Aumentado,

  3. RCBD Aumentado,

  4. Filas-Columnas y

  5. Parcialmente replicado.

Estos son compatibles con la nueva implementación de la interfaz de usuario de la herramienta de creación de experimentos de Core Breeding, específicamente en la pestaña Diseño.


Corrección de errores

Los errores encontrados durante la aleatorización de un diseño aumentado ahora están corregidos.

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titleAnálisis de Datos Moleculares (MDA)

Solicite y vea los resultados de las pruebas de hibridación de F1.

Para comprobar si el genotipo F1 coincide con el genotipo esperado, se realizan pruebas de hibridación F1. Como tal, los usuarios ahora podrán generar resultados de hibridación F1 utilizando solicitudes de genotipeo con el propósito de realizar pruebas de hibridación en la herramienta MDA. Los resultados mostrarán si una muestra es un Verdadero F1 (indicado como 'VERDADERO') cuando el 100% de su genotipo coincide con el esperado. De lo contrario, la muestra se indica como FALSE.

Los resultados también se podrán (blue star) descargar en su dispositivo local. Esta nueva función integra datos de cruza y de marcadores del Cross Manager y GIGWA, respectivamente.

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Vea y descargue datos de haplotipos de consensus para el análisis de pureza parental.

Los datos de haplotipos de consensus permitirá a los usuarios confirmar fácilmente si sus muestras coinciden con el haplotipo esperado. Esto ahora se refleja en el explorador de datos de resultados y en el archivo exportado para las solicitudes de análisis de pureza parental.

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Se ha mejorado el explorador de datos de genotipos.

Se han mejorado las siguientes características para una mejor experiencia de usuario:

  1. Descarga los datos del genotipo. El botón de (blue star) descarga en la barra de herramientas ahora abre una ventana modal que le permitirá personalizar el contenido de su exportación de archivos. Además, se proporciona la opción de incluir clasificación de llamadas de muestra y clasificación de llamadas de marcadores.

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  1. Se ha cambiado el nombre de 'germoplasma' a 'muestra'. Todas las menciones de "germoplasma" se sustituyen por "muestra" en el navegador de datos. Esto es para estandarizar los términos utilizados en el flujo de trabajo de genotipado.

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Correcciones

Ahora puede esperar:

  1. un mensaje de advertencia en el navegador de datos que indica que la solicitud de genotipeo que buscó no existe y

  2. que las clasificaciones de llamada de muestra y marcador que proporcionó se reflejen en los archivos de resultados exportados.

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2024 Trimestre 3

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titlePlataforma de Análisis de Mejoramiento (BA)

Obtener ayuda con las funciones de EBS.

Ahora podrá usar el icono (question) que se encuentra en la barra del menú superior para abrir los enlaces de las guias de usuario y para el escritorio de servicio del EBS. El primero contiene instrucciones paso a paso de como utilizar las herramientas y sus funciones, mientras que el segundo le permitirá solicitar soporte adicional cuando sea necesario.

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Se ha mejorado la visualización y el diseño del navegador.

Se presentan las siguientes mejoras al utilizar herramientas de BA:

  1. Esperé un diseño más compacto y uniforme del navegador y de la página de resultados de análisis, y

  2. Ajuste automático en el diseño según el tamaño de la pantalla del dispositivo para una mejor visualización, donde lo siguiente esta habilitado para pantallas más pequeñas:

    1. botones y leyendas de colores en la tabla de variables y

    2. notificaciones emergentes, carga y mensajes de advertencia.

    3. barras de desplazamiento vertical y horizontal,

    4. fijar encabezados de columnas,

    5. funciones de navegación de página fija al visualizar resultados de trabajo, y

    6. vista compacta de datos y gráficos de salida del trabajo.

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titleAdministrador de Solicitudes de Análisis (ARM)

Se ha mejorado el navegador de ARM.

Se han implementado una serie de mejoras en la forma en la que ve y navega por la herramienta ARM y sus navegadores. Específicamente ahora podrá:

  1. Visualizar las columnas de creador y modificador en el navegador principal,

    image-20240904-015341.pngImage Added

     

  2. Utilice la página de navegación mejorada al visualizar sus solicitudes de análisis, de manera que se proporcionaran como máximo 10 enlaces de páginas.

    image-20241004-020350.pngImage Added

Errores resueltos

No encontrará errores al:

  1. mostrar el navegador de ARM, de manera que se reflejen 10 links de páginas en el menú de navegación,

  2. solicitar MOA, de modo que en el navegador de Experimentos muestre una sola nota cuando no se encentren resultados,

  3. enviar una solucitud de análisis, de modo que el estado no se quede estancado como

    Status
    colourRed
    titlePENDING
    , y

  4. ver los resultados de su solicitud SOA, de modo que el peso de los resultados sea ≥ 0.

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titleAdministrador de Datos Fenotípicos (PDM)

Recibirá una notificación cuando ingrese a las ocurrencias sin datos recopilados.

Ahora inmediatamente se desplegará un panel de información cuando abrá una ocurrencia que no contenga datos de variables recopilados. El mensaje incluirá instrucciones de como solucionar el detalle.

Image Added

Se ha mejorado el navegador de PDM.

Se han implementado una serie de mejoras en la forma en la que ve y navega por la herramienta PDM y sus navegadores. Específicamente ahora podrá:

  1. Desplazarse por la tabla de estadísticas con los encabezados de las columnas intactos,

  2. Fijar o Quitar los encabezados en la tabla de características para congelar columas específicas, y

  3. Mostrar múltiples gráficas de dispersión dentro del espacio de trabajo.

Info

Visualice una demostración completa aquí.


Errores resueltos

Los errores reportados ahora se han corregido. Ahora podrá esperar que las variables sin datos no se muestren en la taba de estadísticas, para evitar errores en los cálculos estadísticos.

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titleModelos de Diseños Estídisticos (SDM)

Generar diseños no-dispersos con conjunto de parámetros que definen el número específico de controles locales.

La función para generar aleatorización para diseños no dispersos Alfa-Lattice, Filas-Columnas, Diseño de Bloques Completos al Azar (RCBD), RCBD Aumentado y bloques incompletos utilizando múltiples conjuntos de parámetros con a) todos los controles locales incluidos, b) Algunos ocntroles locales incluidos, o c) todos los controles locales excluidos ahora estarán habilitados en el Backend de SDM. Se podrá acceder a estas mejoras en la herramienta Creación de Experimentos del Centro de Mejoramiento, específicamente en la pestaña Diseño.


Se actualizaron las definiciones del Diseño.

Se implementaron las definiciones de los diseños Alpha Lattice y Partialmente Replicados (P-Rep). El primero admitirá en sus caso de uso no dispersos mientras que el segundo esta habilitado para casos de uso dispersos. Esto admitirá la implementacion de la nueva interfaz de usuario en la herramienta de Creación de Experimentos del Centro de Mejoramiento, específicamente en la pestaña Diseño.


Errores resueltos

Ahora no encontrará errores cuando cargue diseños disperos de Alpfa-Lattice y diseños no dispersos RCBD Aumentado del Centro de Mejoramiento de la herramienta Creacion de Experimentos para Ensayos de Mejoramiento.

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titleAnálisis de Datos Moleculares (MDA)

Ahora es posible visualizar, limpiar, y descargar datos de genotipos.

Al visualizar ((blue star)) los resultados de las solicitudes de su genotipo, el navegador se divide en dos secciones: el panel superior, donde se encuentra un resumen de la información, y el navegador principal, donde se muestran los datos.

Al usar el panel principal, you can now define the germplasm call rate threshold and the marker call rate threshold to Filter the displayed data. A Reset button is also featured to quickly set the thresholds back to its default value of 95%. On the main browser, the Marker Call Rates for each marker is also shown at the last row of the Genotype Data tab. To view any excluded germplasm and markers based on the set thresholds, the Excluded Germplasm and Excluded Markers tabs are enabled as well. When no germplasm or marker satisfy the indicated threshold filter, a message is displayed.

To allows users to use the genotype data as input for other analyses, the options to download ((blue star)) the filtered or all of the genotype data in either a CSV or TXT file format are also enabled. Beside this is the filename text field, where you can supply your preferred filename or use the auto-generated one.

Info

View the full demo here.


Solicitud de análsis de pureza parental.

Para aseguar que la combinación de la cruza To ensure that cross combinations produce the expected genotype, parental purity analysis is done. As such, genotyping requests with this specific purpose can now be used to request for parental purity analysis via the MDA tool.

Simplemente abra sus resultados de genotipeo usando el icono ((blue star)) para visualizar sus datos y seleccione el botón Request Analysis en la parte superior derecha del navegador. Esto lo redirigira a un anueva página. En la pestaña Pureza Parental, solo es admitido por ahora el Purity testing by internal consensus. Simplemente seleccione el botón Next para revisar los Resultados. En la tabla, se mostraran tanto los resultados TRUE como los FALSE, donde:

  • TRUE indica que todos los marcadores coinciden con el genotipo esperado, y

  • FALSE indicates que almenos un marcado no coincide con el genotipo esperado.

Seleccione el botón Next para visualizar la pestaña Estadísticas. Alelo 1 y Alelo 2 indica el número alelo más común y el segundo más común respectivamente. Al lado de estas columnas, se mostará el número de llamadas que son heterocigotos y valores faltantes. También se proporcionan datos sobre los porcentajes de los mismos, llevando los respectivos conteos divididos por el número total de muestras.

Finalmente, las funciones para descargar y crear el nombre del archivo tambien se alojará justo encima del navegador de datos. Se exporta un archivo comprimido que contiene archivos CSV separados para los resultados y las estadísticas.

Info

Visualice una demostración completa aquí.


Errores resueltos

Ahora podrá usar el botón de restablecer en ambas herramientas germoplasma y datos de marcadores cuando seleccione el botón Reset.

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2024 Trimestre 2

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titleAdministrador de Solicitudes de Análisis (ARM)

Se mejoró la creación de solicitudes de análisis de múltiples ocurrencia (MOA).

Ahora podrá acceder a las siguientes funciones mientras crea sus solicitudes de MOA. Específicamente, ahora podrá:

  1. Seleccione los últimos trabajos finalizados. En la pestaña Experimentos, ahora podrá marcar la casilla de verificación junto al nombre de la ocurrencia para seleccionar todos los ID de trabajos finalizados recientemente. También podrá seleccionar otros ID de trabajo para variables específicas. Además, al anular la selección de un ID de trabajo también se anulará la selección de la casilla junto al nombre de la ocurrencia.

24.05 ARM1.mp4

 

  1. Descargar BLUP. En la pestaña Opciones, ahora podrá agregar BLUP a la lista de datos que puede extraer de los análisis de una sola ocurrencia (SOA). El archivo comprimido resultante contiene el archivo soa_result_predictions_BLUPs.csv. Anteriormente, la opción de incluir BLUP estaba deshabilitada.

24.05 ARM2-20240627-184732.gif

  1. Ver nombres de archivos mejorados. Después de descargar los archivos de resultados de las solicitudes SOA y MOA, los nombres de los archivos ahora contienen un hash único al final, mientras que los archivos de entrada MOA descargados también cambian de nombre. Esto permite que los nombres de archivos sean más descriptivos y que los usuarios pueden identificar fácilmente.

image-20240610-004130-20240627-184805.png


Errores resueltos

No encontrará errores al

  1. Descargar reportes SOA a través de MOA, de modo que las filas de entrada correctas se reflejen sin duplicados

  2. Ver solicitudes con un estado en el que todos los botones y casillas esten deshabilitados y

  3. Ver cada trabajo en una solicitud, de modo que el nombre de la ocurrencia se muestre con precisión.

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titleAdministrador de datos fenotípicos (PDM)

Visualice datos de variables con al menos un datos bueno o cuestionable.

En las pestañas Gráfico de caja Box Plot, Histograma Histogram, Gráfico de dispersión Scater plot y Mapa de calor Mapa de calor, el recuadro de la lista de variables ahora solo contiene aquellas variables con al menos un dato de una variable de parcela cuyo código de control de calidad (QC) es bueno o cuestionable. De lo contrario, el recuadro de lista de variables estará vacío. Esta característica le permitirá a los usuarios generar visualizaciones válidas a partir de sus conjuntos de datos de variables de parcelas. Anteriormente, todos las variables estaban habilitadas para visualizarlas de forma predeterminada.

24.05 PDM1.mp4

Se mejoró la adminsitración de los datos de las varibles de las parcelas.

Para mejorar la experiencia del usuario, se presentan las siguientes mejoras:

  1. Ver las mejoras en los colores de los gráficos. Un tono verde más oscuro ahora colorea los gráficos de todas las visualizaciones para lograr un mejor contraste. Anteriormente, los gráficos tenían un tono verde más claro.

image-20240610-020436-20240627-184623.png

  1. Proceso de guardado optimizado. Esta mejora se implementa para evitar errores de tiempo de espera al guardar varios cambios a la vez.


Errores reueltos

Ahora podrá ver los datos de parcela de la tabla de variables apropiadamente, de modo que los datos permanezcan vsibles incluso después de filtrar y navegar en las otras pestañas.

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titleDiseño de Modelos estadísticos (SDM)

Se mejorarón los diseños no dispersos.

Se actualizó la definición de los siguientes diseños no dispersos ya habilitados:

  1. Alpha-Laticce

  2. Diseño de bloques completos al azar (RCBD),

  3. RCBD aumentado y

  4. Parcialmente replicado (P-Rep).

Esto admite la implementación de la nueva interfaz de usuario en la herramienta de Creación de Experimentos del Centro de Mejoramiento, específicamente en la pestaña Diseño.


Errores resueltos

Ahora no encontrará errores al cargar archivos de aleatorización, incluso cuando las columnas de coordenadas de campo estén vacías

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titleAnálisis de Datos Moleculares (MDA)

Explore y vea solicitudes de genotipeo y sus datos.

En el panel de navegación izquierdo, seleccione la herramienta MDA. Esto debería abrir el navegador de datos recién habilitado, que alberga solicitudes de genotipeo y su información básica. El icono le permite ver ((blue star)) los datos de la solicitud almacenados en las siguientes pestañas: Datos de genotipeo Genotype data, Germoplasma excluido Excluded germplams y Marcadores excluidos Excluded Markers. Un panel de información también le proporcionará un resumen de germoplasma y de marcadores, así como el umbral de rango de las llamadas. A partir de esta versión, las funciones de filtro en las pestañas y botones del Umbral de rango de llamadas aún no funcionan, mientras que los datos sobre Marcadores excluidos aún no están disponibles.

24.05 MDA1-20240627-184531.gif

Errores resueltos

No encontrará errores cuando este navegando en el buscador de MDA y este visulizando las solicitudes de genotipe.

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titlePlataforma de Análisis de Mejoramiento (BAP)

Se mejoró el acceso a herramientas y programas.

Esta versión mejoró lo siguiente:

  1. Programas. En el filtro de datos del programa, ahora aparecerá un menú desplegable desplazable cuando hay más de 10 programas disponibles para seleccionar. Esto permitirá una visualización eficiente, evitando que la lista ocupe toda la pantalla.

image-20240610-034556-20240627-184408.png

 

  1. Se acabó el tiempo. Después de una hora de inactividad, se cerrará tu sesión en BA. Se mostrará una notificación para informarle que se ha cerrado su sesión debido a inactividad. Simplemente inicie sesión nuevamente para reanudar sus actividades

Screenshot 2024-05-27 103435-20240627-184445.png

Errores resueltos

El filtro de programa ahora funciona como se esperaba, los datos de los programas seleccionados serán reflejados.

...

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titleAdministrador de Datos Fenotípicos (PDM)

Se ha mejorado la supresión de valores en la pestaña Diagrama de caja.

Se presentan las siguientes mejoras:

  1. Suprimir los valores de las variables con diagramas de caja generados. Después de generar los gráficos de diagrama de caja para algunas o todas las variables de su ocurrencia, se habilita la función Suprimir valores. Aquí, ahora podrá seleccionar la variable cuyos datos desea suprimir. Simplemente seleccione en el menú desplegable Variable para ver las variables disponibles para su selección. Tenga en cuenta que en esta lista solo se podrán ver aquellas variables con diagramas de caja creados. Posteriormente, defina a) el límite superior y/o b) los valores de la variables del límite inferior que desea suprimir. Seleccione el botón Suprimir Suppress para aplicar los cambios al gráfico de diagrama de caja. Estos cambios también se reflejan en la tabla de estadísticas y variables.

24.04 PDM new version.mp4

 

  1. Suprimir datos buenos y cuestionables. Además de los valores atípicos, ahora también podrá suprimir los que no son atípicos, como los datos de variables buenos (G) y cuestionables (Q). Posteriormente seleccione el botón, los gráficos del diagrama de caja también se actualizarán. Esta función también pasa a llamarse "Suprimir valores" para indicar correctamente el alcance completo de su funcionalidad

24.04 PDM1-20240627-183821.gif


Errores resueltos

Los problemas reportados se resolvieron. Ahora podrá:

  1. Ver ocurrencias con el estado

    Status
    titleTRAIT DATA COLLECED
    en el navegador de datos de PDM según el filtro de datos del programa seleccionado

  2. Abrir una ocurrencia desde Administrador de Experimentos y conservar el mismo filtro de datos del programa en PDM y

  3. Generar mapas de calor, tales que:

    1. Todos los valores de las variables supresos, faltantes y malos ahora serán de color gris y

    2. Las ocurrencias sin datos de bloque no tendrán la opción de bloque Block en el menú desplegable.

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titleDiseño de Modelos Estadísticos (SDM)

Se mejoran los procesos relacionados con la aleatorización y la carga de diseños.

Las mejoras de backend ahora se aplicarán a la herramienta de Creación de Experimentos del dominio Centro de Mejoramiento al generar aleatorizaciones para el diseño de sus Ensayos de Mejoramiento. Específicamente, ahora podrá:

  1. Ver la notificación de error para el archivo de diseño RCBD cargado con las columnas de Rep y Block. En la ventana modal de carga, ahora se mostrará un mensaje de error cuando cargue archivos de diseño RCBD que contengan columnas de Rep y Block. Esto se debe a que, para pruebas dispersas y no dispersas, RCBD solo requerirán los valores de Rep o Block pero no ambos.

  2. Utilizar el diseño P-Rep actualizado. Los cambios en la definición del diseño parcialmente replicado (P-Rep) no disperso ahora se implementan en la pestaña Diseño de la herramienta de Creación de Experimentos del dominio Centro de Mejoramiento, donde no se requiere la información del repetición. Esto mejora tanto la interfaz frontal como la validación del backend.


Errores Resueltos

No encontrará errores al cargar y validar un archivo de diseños P-Rep, aumentados y no definidos con o sin repeticiones.

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2024 Trimestre 1

(blue star) Versión 24.03.26

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titleAdministrador de Solicitudes de Análisis (ARM)

Ahora se admitirá la descarga de resultados de análisis para cada trabajo.

Esta función le permitirá descargar el archivo de resultados para cada uno de los trabajos de análisis de ocurrencia única que haya

Status
colourBlue
titleFINALIZED
. En el navegador de datos ARM, se habilita un ícono de descarga ((blue star)) al lado de cada uno de estos. Anteriormente, el archivo de resultados solo se podía descargar para cada solicitud cuando su estado este
Status
colourBlue
titleCLOSED
.

image-20240326-075253.png

Las notificaciones de descarga ahora son consistentes.

Al descargar los resultados de sus solicitudes, las notificaciones que se muestran ahora tienen mensajes estándar donde se muestra el nombre de la solicitud o el nombre del trabajo

image-20240326-075635.png

Errores resueltos

La Tabla de Residuales ahora muestra la cantidad correcta de registros para cada variable analizado dentro de cada ocurrencia, mientras que los informes MOA ahora se generan sin filas duplicadas

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titleAdministrador de Datos Fenotípicos (PDM)

La validación del tipo de datos ahora está habilitada antes de que se cambien los códigos de control de calidad.

Al convertir los códigos de control de calidad (QC) de códigos de variables de datos de malos y supresos en buenos, ahora se aplica la validación del tipo de datos para comprobar si dichos cambios son permitidos o no. El proceso garantiza que sólo aquellos datos de variables con formatos válidos puedan convertirse en buenos.

Ejemplos de variables

Tipo de Datos

Reglas de Validación

Ejemplo de valores validos

Moisture Content

flotantes

contienen “.”

1.55

Grain Type Score

enteros

son aquellos que no contienen “.”

4

Fecha de Cosecha

fecha

contienen “-”

2024-02-26

Método de Cosecha

Variación de caracteres

no es un número y no contienen “-”

Bulk

En la tabla de variables, use el clic derecho en los datos de variables con el código de control de calidad incorrecto, suprimido o cuestionable. La opción de convertirlos en Bueno o Cuestionable solo estará disponible si el formato de datos de la variable actual cumple con el formato de datos esperado para esa avriable y su tipo de datos. De lo contrario, estas opciones de códigos de control de calidad están deshabilitadas. También se proporciona una breve explicación para su referencia. Por último, esta función también se puede aplicar al cambiar los códigos de control de calidad de forma individual o en masa.

24.03 PDM.gif
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titleModelos de Diseños Estadísticos (MDE, SDM)

Se mejoran los procesos relacionados con la carga de diseños de aleatorización.

 Ahora se puede observar lo siguiente en la pestaña Diseño de la herramienta de creación de experimentos de Centro de Mejoramiento para experimentos de Ensayos de Mejoramiento:

  1. Estado de solicitud de diseño cancelado y mensaje de error. Cuando el sistema encuentra un error en el procesamiento de su archivo de aleatorización cargado, se muestra el estado

    Status
    colourRed
    titleCANCELED
    de la solicitud de diseño junto con una breve nota sobre por qué falló el procesamiento. Los errores pueden deberse a 1) un archivo no válido, 2) faltan columnas requeridas o 3) una discrepancia en el número de apariciones en EBS y el número de apariciones en el archivo cargado.

  2. Se eliminaron algunas reglas de validación para la carga de archivos con diseño no definidos. Ya no es necesario que todas las entradas del experimento estén presentes por ocurrencia, tanto para pruebas dispersas como no dispersas. Además, ya no es necesario que todas las ocurrencias tengan entradas superpuestas con otras ocurrencias en todos los conjuntos de parámetros para realizar pruebas dispersas.


Errores resueltos

Ahora no encontrará errores al:

  1. guardar valores de bloque de un diseño no definido cargado para pruebas dispersas,

  2. generar parcelas utilizando pruebas dispersas, de modo que el recuento de parcelas no exceda el número máximo de parcelas indicado, y

  3. validar un archivo de aleatorización cargado que contenga columnas adicionales.

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titlePlataforma de Análisis de Mejoramiento (BAP)

Se mejoró el acceso a herramientas y programas

 En esta versión mejoró lo siguiente:

  1. Programas. Los usuarios con roles de administrador ahora podrán ver y seleccionar cualquiera de los programas disponibles en EBS. Esto le permitirá cargar las herramientas ARM y PDM con los datos del programa. Simplemente seleccione el Nombre del programa ubicado en la barra de menú para cambiar el filtro de datos del programa actual seleccionado.

24.03 BAP.gif

 

  1. Herramientas BA. Con la implementación del Control de acceso basado en roles (RBAC), el acceso a las herramientas de BA ahora depende de los permisos otorgados a su perfil de usuario. En los casos en los que sepa cómo acceder a una herramienta a través de la URL y no tenga permiso para hacerlo, se mostrará un mensaje de error informándole de esta limitación. De lo contrario, no debería tener problemas para utilizar las herramientas de BA para las que tiene acceso.

image-20240326-063854.png

...

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titleAdministrador de Solicitudes de Análisis (ARM)

Vea números de parcela, números de entrada, nombres de entrada y códigos de germoplasma en archivos de resultados y salidas de trabajo SOA.

Al visualizar ((blue star)) resultados de trabajos de solicitudes de análisis de ocurrencia única (SOA), la Tabla de Residuos ahora muestra nuevas columnas para números de parcela, números de entrada, nombres de entrada y códigos de germoplasma. La pestaña Predicciones también muestra los últimos tres. Estos también aparecen en los archivos de resultados de análisis descargados ((blue star)). Estas mejoras permitirán una identificación y un análisis de datos más sencillos.

image-20240228-054326.png

Se ha mejorado la descarga de archivos de resultados de análisis SOA.

En el navegador de datos ARM, el estado de una solicitud SOA no se establecerá hasta que este cerrado

Status
colourBlue
titleCLOSE
y los archivos de los resultados del análisis estén listos para descargarse. Una vez que haga clic en el ícono de descarga ((blue star)), el archivo comprimido debería estar disponible en su dispositivo.


Ahora se admitirán solicitudes de análisis de ocurrencias múltiples (MOA).

En el navegador de datos de ARM, el menú desplegable Solicitar análisis ahora incluye la opción para solicitar MOA. Con las siguientes características:

  1. Pestaña Experimentos. Esto enumera todas las entradas de trabajo SOA

    Status
    colourBlue
    titleCLOSED
    que podrá seleccionar. Expanda (>) cada fila para mostrar todos los ID de trabajo para cada rasgo analizado. El requisito mínimo para proceder con la solicitud de MOA es seleccionar al menos dos (2) entradas de trabajo bajo el mismo rasgo de diferentes ocurrencias. Al hacerlo, se habilita el botón Siguiente. Sin embargo, aún puede agregar entradas de trabajo individuales de diferentes características para incluirlas en la solicitud de MOA. El sistema lo permitirá, pero se proporcionará una notificación una vez que haga clic en Siguiente.

image-20240301-064605.png

 

  1. Pestaña de opciones. Aquí se encuentran las opciones disponibles para usted. Específicamente, podrá:

    1. Descargar únicamente archivos de resultados SOA. Esta opción le permite extraer BLUE y métricas de análisis en formato CSV. Al seleccionar uno o ambos archivos de resultados se activa el botón Enviar Submit, seleccionelo para confirmar la descarga y redirigirlo al navegador ARM. Por el momento, los BLUP aún no son compatibles.

image-20240301-065455.png
  1. Solicitud de MOA únicamente [segundo paso]. Esta opción le permite crear una (1) solicitud de MOA. Podrá definir los parámetros del umbral H2 antes de seleccionar el botón Enviar Submit, que luego lo redireccionará al navegador ARM. Una vez hecho esto, se podrán ver los resultados del trabajo ((blue star)) para cada variable analizada.

image-20240301-065717.png
  1. Descargar los resultados de SOA y solicitar MOA [segundo paso]. Esto le permitirá continuar con las dos opciones anteriores. Simplemente envíe su solicitud para ser redirigido al navegador ARM y espere a que finalicen los análisis

image-20240301-073336.png

 

  1. Salidas de trabajos. En el navegador de datos ARM, los botones de acción se habilitan una vez que los resultados del trabajo esten listos para su solicitud MOA. Podrá ver ((blue star)) la página de resultados, donde se muestra una lista de trabajos en la sección más a la izquierda, mientras que los resultados de los trabajos están a la derecha. En esta versión, los resultados del trabajo admitidos son las métricas de análisis y las predicciones. También podrá descargarlos ((blue star)) en tu dispositivo

image-20240301-071029.png
Info

Vea una demostración completa aquí.


Errores resueltos

Se resolvieron los siguientes problemas reportados. Ahora podrá:

  1. crear una solicitud de análisis sin encontrar errores,

  2. descargar informes de análisis SOA (.xlsx) predicciones MOA y resultados de BLUEs y

  3. excluir correctamente las ocurrencias sin variables sin control de calidad verificada (QC) y cuyos datos de las variables tengan un código de control de calidad incorrecto (B) en la pestaña Experimentos SOA

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titleAdministrador de Datos Fenotípicos (PDM)

Se ha mejorado la visualización de datos del PDM.

Esta versión mejora las siguientes características en el navegador de datos principal y en los navegadores de datos de ocurrencia. Específicamente, ahora podrás:

  1. Ver estados de ocurrencia. Además de otra información básica, el navegador de datos del PDM ahora también muestra el estado de ocurrencia. Esto se puede ver después de expandir (>) un experimento para ver sus ocurrencias. Para recordar, el navegador de datos del PDM solo enumera ocurrencias con los siguientes estados:

    Status
    colourGreen
    titlePLANTED
    Status
    titleTRAIT DATA COLLECTED
    y
    Status
    titleTRAIT DATA QUALITY CHECKED
    .

PDM1.png
  1. Ver más experimentos y ocurrencias. Ahora podrá ver todos los tipos de experimentos en el navegador de datos de PDM. Como tal, los datos de varables de todos los experimentos y ocurrencias ahora se podrán inspeccionar utilizando PDM. Anteriormente, solo los experimentos de Ensayos de Mejoramiento (BT) estaban disponibles para verificar la calidad de los datos de las variables

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  1. Cambie para ver otra ocurrencia del mismo experimento. Ahora podrá pasar fácilmente de ver los datos de las variables de una ocurrencia a otra desde el mismo experimento. Simplemente seleccione otra ocurrencia para desplegar con el nuevo menú desplegable justo encima de las subpestañas y espere a que se carguen los datos de la nueva variable. Esta característica también es aplicable al generar diagramas de caja, histograma, diagrama de dispersión y mapas de calor. Tenga en cuenta que el menú desplegable está deshabilitado para experimentos con una sola ocurrencia

PDM2.gif

Se mejoró la administración de transacciones.

Se actualizan las siguientes funciones relacionadas con la gestión y el almacenamiento de transacciones:

  1. Guarde solo experimentos BT, excepto aquellos que usan la etapa OFT. Guarde (💾) y envie las transacciones para su análisis a ARM solo se aplica a los experimentos de BT cuya etapa no sea la On-Farm Trail (OFT). Esto está relacionado con la mejora en la visualización de todos los tipos de experimentos en el navegador de datos de PDM. Se muestra un mensaje de advertencia en la ventana modal Guardar transacción para informar a los usuarios de esta limitación cuando intentan guardar la transacción de un tipo y etapa de experimento no admitidos. De manera similar, el botón Analizar Analyze permanecerá deshabilitado para estos casos no admitidos

PDM3.gif
  1. Guarde transacciones con o sin seleccionar variables. En la ventana modal Guarde su transacción, se proporciona una nueva descripción para informarle que ahora podrá guardar su transacción con o sin seleccionar variables. Ambos cambios guardados se reflejan en el Administrador de experimentos del Centro de Mejoramiento. Anteriormente, solo podía guardar una transacción después de seleccionar las variables. Esta mejora influye en los códigos de control de calidad (QC) de los datos guardados (💾), específicamente para los datos cuestionables (Q). Esto significa que en cada transacción guardada:

    1. Los datos cuestionables (Q) se convierten en buenos (G) para las variables seleccionadas, mientras que

    2. Los datos cuestionables (Q) y todos los demás códigos de control de calidad de datos se conservan para las variables no seleccionadas.

PDM4.gif
  1. Los criterios revisados ​​ahora se aplican al seleccionar varibles como QCed. Las columnas de datos de variables con al menos un (1) dato bueno y ningún dato cuestionable ahora se podrá marcar como con control de calidad (QCed), siempre que el usuario lo haga explícitamente mediante la ventana modal Guardar transacción. Además, las variables cuyos datos sean todos o tienen una combinación de cuestionables, suprimidos, malos y faltantes no se podrán marcar como QCed.

    Anteriormente, se podía realizar un control de calidad a las columnas de variables si:

    1. todos sus datos no son (NA),

    2. no tiene datos cuestionables y

    3. ha sido marcado explícitamente como QCed.

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titleDiseños de Modelos Estadisticos (SDM)

Ahora se admitirá la carga de archivos de aleatorización de pruebas dispersas generados fuera de EBS.

En EBS, las pruebas dispersas son una forma de asignar aleatoriamente entradas de prueba a diferentes ocurrencias. Los grupos de ocurrencias con protocolos específicos se denominan conjuntos de parámetros. Estas configuraciones incluyen los diseños de prueba aplicados a los conjuntos de parámetros.

En esta versión, las funciones de backend para admitir la carga de archivos de aleatorización para pruebas dispersas ahora estarán habilitadas en la herramienta de creación de experimentos del dominio Centro de Mejoramiento. Esto le permitirá a los usuarios cargar sus propios archivos de aleatorización cuyos conjuntos de parámetros utilicen el diseño no definido y todos los demás diseños de ensayos respaldados por EBS, excepto IWIN y OFT, sujetos a reglas de validación.


Errores resueltos

No encontrara errores al:

  1. validar un archivo de prueba no disperso en la herramienta de creación de experimentos del Centro de Mejoramiento y

  2. generar la aleatorización para pruebas dispersas, donde el número total de parcelas creadas ahora es menor o igual al NRep definido por entrada.

...

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titleAdministrador de Solicitudes de Análisis (ARM)

Errores resueltos

En la Tabla de Residuales, se resuelvió el error que provocaba que los filtros de columna se restablecieran después de seleccionar las casillas.

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titleAdministrador de Datos Fenotípicos (PDM)

Permanezca en PDM después de haber realizado el control de calidad de todas las variables.

Después de guardar ((blue star) ) y seleccionar todas las variables con control realizado (QCed), ahora podrá permanecer en PDM para revisar a detalle los datos de las variables de su ocurrencias. Una vez hecho esto, podrá seleccionar el botón Analizar Analize para pasar a la herramienta ARM manualmente. Anteriormente, los usuarios eran redirigidos automáticamente a ARM una vez que se habían realizado el control de calidad todos las variables.

24.01 PDM1.gif

Errores resueltos

No encontrará errrores al:

  1. Visualizar valores precisos de X, Y y Z en los gráficos mapas de calor y

  2. Procesar todas las variables QCed que se hayan guardado

...